Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgm3Q08189 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms