Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
MestQ07646 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MestQ07646 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MestQ07646 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MestQ07646 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
MestQ07646 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MestQ07646 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MestQ07646 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MestQ07646 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MestQ07646 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MestQ07646 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MestQ07646 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MestQ07646 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MestQ07646 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MestQ07646 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MestQ07646 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MestQ07646 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MestQ07646 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MestQ07646 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MestQ07646 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MestQ07646 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MestQ07646 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MestQ07646 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MestQ07646 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MestQ07646 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MestQ07646 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MestQ07646 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MestQ07646 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MestQ07646 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MestQ07646 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
MestQ07646 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
MestQ07646 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MestQ07646 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MestQ07646 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MestQ07646 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MestQ07646 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MestQ07646 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MestQ07646 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MestQ07646 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MestQ07646 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MestQ07646 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MestQ07646 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MestQ07646 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MestQ07646 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MestQ07646 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MestQ07646 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MestQ07646 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MestQ07646 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MestQ07646 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MestQ07646 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MestQ07646 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MestQ07646 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MestQ07646 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MestQ07646 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MestQ07646 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MestQ07646 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MestQ07646 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MestQ07646 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MestQ07646 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MestQ07646 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MestQ07646 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MestQ07646 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MestQ07646 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MestQ07646 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MestQ07646 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MestQ07646 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
MestQ07646 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MestQ07646 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MestQ07646 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MestQ07646 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
MestQ07646 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MestQ07646 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MestQ07646 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MestQ07646 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MestQ07646 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MestQ07646 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MestQ07646 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MestQ07646 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MestQ07646 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MestQ07646 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
MestQ07646 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MestQ07646 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MestQ07646 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MestQ07646 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MestQ07646 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MestQ07646 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MestQ07646 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MestQ07646 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MestQ07646 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MestQ07646 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MestQ07646 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MestQ07646 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MestQ07646 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MestQ07646 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MestQ07646 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MestQ07646 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MestQ07646 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MestQ07646 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MestQ07646 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
MestQ07646 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms