Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms