Protein–RNA interactions for Protein: Q05BQ1

Igsf9, Protein turtle homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf9Q05BQ1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igsf9Q05BQ1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igsf9Q05BQ1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igsf9Q05BQ1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igsf9Q05BQ1 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igsf9Q05BQ1 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igsf9Q05BQ1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igsf9Q05BQ1 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igsf9Q05BQ1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igsf9Q05BQ1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igsf9Q05BQ1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Igsf9Q05BQ1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igsf9Q05BQ1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igsf9Q05BQ1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igsf9Q05BQ1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igsf9Q05BQ1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igsf9Q05BQ1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Igsf9Q05BQ1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igsf9Q05BQ1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igsf9Q05BQ1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igsf9Q05BQ1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igsf9Q05BQ1 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igsf9Q05BQ1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Igsf9Q05BQ1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Igsf9Q05BQ1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Igsf9Q05BQ1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igsf9Q05BQ1 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Igsf9Q05BQ1 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igsf9Q05BQ1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igsf9Q05BQ1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igsf9Q05BQ1 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igsf9Q05BQ1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igsf9Q05BQ1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igsf9Q05BQ1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igsf9Q05BQ1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igsf9Q05BQ1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Igsf9Q05BQ1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Igsf9Q05BQ1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Igsf9Q05BQ1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Igsf9Q05BQ1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igsf9Q05BQ1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igsf9Q05BQ1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Igsf9Q05BQ1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Igsf9Q05BQ1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Igsf9Q05BQ1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igsf9Q05BQ1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igsf9Q05BQ1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igsf9Q05BQ1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igsf9Q05BQ1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igsf9Q05BQ1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igsf9Q05BQ1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igsf9Q05BQ1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igsf9Q05BQ1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igsf9Q05BQ1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Igsf9Q05BQ1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igsf9Q05BQ1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Igsf9Q05BQ1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igsf9Q05BQ1 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igsf9Q05BQ1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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Igsf9Q05BQ1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igsf9Q05BQ1 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igsf9Q05BQ1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igsf9Q05BQ1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Igsf9Q05BQ1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igsf9Q05BQ1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igsf9Q05BQ1 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igsf9Q05BQ1 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igsf9Q05BQ1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igsf9Q05BQ1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igsf9Q05BQ1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Igsf9Q05BQ1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igsf9Q05BQ1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igsf9Q05BQ1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Igsf9Q05BQ1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igsf9Q05BQ1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igsf9Q05BQ1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igsf9Q05BQ1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igsf9Q05BQ1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igsf9Q05BQ1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igsf9Q05BQ1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igsf9Q05BQ1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Igsf9Q05BQ1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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