Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Thbs3Q05895 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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