Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Top1Q04750 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Top1Q04750 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Top1Q04750 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top1Q04750 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top1Q04750 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top1Q04750 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Top1Q04750 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top1Q04750 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms