Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Emx2Q04744 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Emx2Q04744 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Emx2Q04744 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Emx2Q04744 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Emx2Q04744 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Emx2Q04744 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Emx2Q04744 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Emx2Q04744 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Emx2Q04744 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Emx2Q04744 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Emx2Q04744 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Emx2Q04744 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Emx2Q04744 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Emx2Q04744 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Emx2Q04744 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Emx2Q04744 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Emx2Q04744 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Emx2Q04744 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Emx2Q04744 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Emx2Q04744 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Emx2Q04744 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Emx2Q04744 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Emx2Q04744 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Emx2Q04744 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Emx2Q04744 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Emx2Q04744 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Emx2Q04744 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Emx2Q04744 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms