Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pfdn6Q03958 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms