Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl7Q03366 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccl7Q03366 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms