Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gjb5Q02739 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb5Q02739 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb5Q02739 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb5Q02739 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb5Q02739 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb5Q02739 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb5Q02739 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb5Q02739 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb5Q02739 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gjb5Q02739 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms