Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GscQ02591 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GscQ02591 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GscQ02591 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GscQ02591 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GscQ02591 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GscQ02591 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GscQ02591 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GscQ02591 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GscQ02591 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GscQ02591 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GscQ02591 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GscQ02591 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GscQ02591 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GscQ02591 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GscQ02591 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GscQ02591 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GscQ02591 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GscQ02591 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GscQ02591 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GscQ02591 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GscQ02591 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GscQ02591 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GscQ02591 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GscQ02591 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GscQ02591 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GscQ02591 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GscQ02591 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GscQ02591 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GscQ02591 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GscQ02591 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GscQ02591 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GscQ02591 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GscQ02591 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GscQ02591 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GscQ02591 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GscQ02591 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GscQ02591 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GscQ02591 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GscQ02591 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GscQ02591 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GscQ02591 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GscQ02591 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GscQ02591 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GscQ02591 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GscQ02591 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GscQ02591 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GscQ02591 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GscQ02591 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GscQ02591 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GscQ02591 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GscQ02591 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GscQ02591 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GscQ02591 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GscQ02591 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GscQ02591 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GscQ02591 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GscQ02591 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GscQ02591 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GscQ02591 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GscQ02591 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GscQ02591 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GscQ02591 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GscQ02591 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GscQ02591 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GscQ02591 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GscQ02591 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GscQ02591 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GscQ02591 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GscQ02591 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GscQ02591 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GscQ02591 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GscQ02591 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GscQ02591 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GscQ02591 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GscQ02591 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GscQ02591 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GscQ02591 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GscQ02591 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GscQ02591 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GscQ02591 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GscQ02591 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GscQ02591 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GscQ02591 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GscQ02591 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GscQ02591 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GscQ02591 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GscQ02591 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GscQ02591 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GscQ02591 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GscQ02591 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GscQ02591 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GscQ02591 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GscQ02591 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GscQ02591 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GscQ02591 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GscQ02591 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GscQ02591 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GscQ02591 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GscQ02591 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms