Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd1Q01822 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms