Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbp1Q01514 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms