Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EgfrQ01279 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EgfrQ01279 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EgfrQ01279 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EgfrQ01279 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EgfrQ01279 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EgfrQ01279 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EgfrQ01279 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EgfrQ01279 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EgfrQ01279 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EgfrQ01279 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EgfrQ01279 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EgfrQ01279 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EgfrQ01279 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EgfrQ01279 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EgfrQ01279 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EgfrQ01279 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EgfrQ01279 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms