Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb2Q00977 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms