Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serpina1cQ00896 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms