Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Rbp4Q00724 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms