Protein–RNA interactions for Protein: Q00175

Pgr, Progesterone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgrQ00175 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PgrQ00175 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PgrQ00175 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PgrQ00175 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PgrQ00175 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PgrQ00175 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PgrQ00175 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PgrQ00175 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PgrQ00175 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PgrQ00175 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PgrQ00175 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PgrQ00175 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PgrQ00175 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PgrQ00175 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PgrQ00175 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PgrQ00175 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PgrQ00175 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PgrQ00175 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PgrQ00175 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PgrQ00175 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PgrQ00175 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PgrQ00175 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PgrQ00175 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PgrQ00175 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PgrQ00175 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PgrQ00175 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PgrQ00175 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PgrQ00175 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PgrQ00175 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PgrQ00175 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms