Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shc1P98083 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shc1P98083 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Shc1P98083 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shc1P98083 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Shc1P98083 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Shc1P98083 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Shc1P98083 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Shc1P98083 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Shc1P98083 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Shc1P98083 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Shc1P98083 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shc1P98083 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shc1P98083 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shc1P98083 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shc1P98083 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shc1P98083 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shc1P98083 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shc1P98083 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shc1P98083 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shc1P98083 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shc1P98083 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shc1P98083 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shc1P98083 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shc1P98083 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shc1P98083 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shc1P98083 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shc1P98083 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shc1P98083 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shc1P98083 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shc1P98083 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shc1P98083 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shc1P98083 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shc1P98083 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Shc1P98083 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shc1P98083 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shc1P98083 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shc1P98083 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shc1P98083 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Shc1P98083 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shc1P98083 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shc1P98083 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shc1P98083 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shc1P98083 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shc1P98083 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shc1P98083 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shc1P98083 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shc1P98083 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shc1P98083 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shc1P98083 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shc1P98083 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shc1P98083 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shc1P98083 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shc1P98083 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shc1P98083 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shc1P98083 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shc1P98083 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shc1P98083 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shc1P98083 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Shc1P98083 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shc1P98083 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shc1P98083 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Shc1P98083 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Shc1P98083 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms