Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bop1P97452 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Bop1P97452 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bop1P97452 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bop1P97452 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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