Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lig3P97386 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lig3P97386 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lig3P97386 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lig3P97386 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lig3P97386 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lig3P97386 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lig3P97386 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lig3P97386 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lig3P97386 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lig3P97386 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lig3P97386 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms