Protein–RNA interactions for Protein: P97353

Sec1, Galactoside 2-alpha-L-fucosyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec1P97353 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec1P97353 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec1P97353 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec1P97353 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec1P97353 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec1P97353 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec1P97353 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec1P97353 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec1P97353 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec1P97353 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec1P97353 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms