Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms