Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx3P70354 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx3P70354 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx3P70354 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx3P70354 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msx3P70354 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx3P70354 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx3P70354 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx3P70354 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx3P70354 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msx3P70354 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms