Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms