Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf6P70279 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf6P70279 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf6P70279 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf6P70279 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf6P70279 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms