Protein–RNA interactions for Protein: P63154

Crnkl1, Crooked neck-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crnkl1P63154 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Crnkl1P63154 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms