Protein–RNA interactions for Protein: P62932

Fbxo40, F-box only protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo40P62932 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fbxo40P62932 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms