Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rps3P62908 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rps3P62908 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rps3P62908 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rps3P62908 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rps3P62908 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rps3P62908 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rps3P62908 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rps3P62908 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rps3P62908 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rps3P62908 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms