Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Vsnl1P62761 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms