Protein–RNA interactions for Protein: P62717

Rpl18a, 60S ribosomal protein L18a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl18aP62717 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms