Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snrpd3P62320 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms