Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp46P62069 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp46P62069 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp46P62069 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp46P62069 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp46P62069 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp46P62069 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Usp46P62069 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp46P62069 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp46P62069 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp46P62069 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp46P62069 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Usp46P62069 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp46P62069 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp46P62069 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp46P62069 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Usp46P62069 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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