Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga11P61622 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga11P61622 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga11P61622 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga11P61622 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga11P61622 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga11P61622 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga11P61622 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Itga11P61622 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga11P61622 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga11P61622 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga11P61622 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms