Protein–RNA interactions for Protein: P61219

Polr2f, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2fP61219 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2fP61219 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms