Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snap25P60879 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Snap25P60879 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snap25P60879 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snap25P60879 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snap25P60879 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Snap25P60879 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Snap25P60879 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snap25P60879 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms