Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcbp1P60335 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcbp1P60335 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms