Protein–RNA interactions for Protein: P58801

Ripk2, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk2P58801 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ripk2P58801 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ripk2P58801 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ripk2P58801 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ripk2P58801 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ripk2P58801 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ripk2P58801 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ripk2P58801 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ripk2P58801 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ripk2P58801 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ripk2P58801 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ripk2P58801 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ripk2P58801 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ripk2P58801 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ripk2P58801 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ripk2P58801 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ripk2P58801 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ripk2P58801 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ripk2P58801 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ripk2P58801 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ripk2P58801 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk2P58801 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk2P58801 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk2P58801 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk2P58801 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk2P58801 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk2P58801 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk2P58801 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk2P58801 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk2P58801 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ripk2P58801 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk2P58801 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk2P58801 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk2P58801 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk2P58801 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk2P58801 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk2P58801 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk2P58801 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk2P58801 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk2P58801 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk2P58801 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk2P58801 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk2P58801 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk2P58801 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk2P58801 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk2P58801 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk2P58801 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk2P58801 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk2P58801 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk2P58801 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk2P58801 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk2P58801 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk2P58801 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk2P58801 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk2P58801 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ripk2P58801 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ripk2P58801 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ripk2P58801 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ripk2P58801 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ripk2P58801 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ripk2P58801 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ripk2P58801 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ripk2P58801 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ripk2P58801 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ripk2P58801 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ripk2P58801 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ripk2P58801 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ripk2P58801 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ripk2P58801 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ripk2P58801 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ripk2P58801 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ripk2P58801 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ripk2P58801 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ripk2P58801 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ripk2P58801 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ripk2P58801 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ripk2P58801 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ripk2P58801 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ripk2P58801 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ripk2P58801 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ripk2P58801 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ripk2P58801 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ripk2P58801 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ripk2P58801 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ripk2P58801 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ripk2P58801 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ripk2P58801 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ripk2P58801 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ripk2P58801 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ripk2P58801 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ripk2P58801 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ripk2P58801 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ripk2P58801 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ripk2P58801 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ripk2P58801 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ripk2P58801 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ripk2P58801 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ripk2P58801 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ripk2P58801 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ripk2P58801 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms