Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Setd4P58467 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Setd4P58467 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Setd4P58467 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Setd4P58467 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Setd4P58467 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Setd4P58467 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Setd4P58467 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Setd4P58467 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Setd4P58467 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Setd4P58467 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Setd4P58467 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Setd4P58467 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Setd4P58467 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Setd4P58467 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Setd4P58467 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Setd4P58467 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Setd4P58467 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Setd4P58467 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Setd4P58467 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Setd4P58467 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Setd4P58467 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Setd4P58467 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Setd4P58467 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Setd4P58467 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Setd4P58467 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Setd4P58467 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Setd4P58467 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Setd4P58467 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Setd4P58467 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Setd4P58467 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Setd4P58467 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Setd4P58467 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Setd4P58467 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Setd4P58467 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Setd4P58467 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Setd4P58467 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Setd4P58467 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Setd4P58467 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Setd4P58467 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Setd4P58467 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Setd4P58467 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Setd4P58467 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Setd4P58467 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Setd4P58467 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Setd4P58467 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Setd4P58467 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Setd4P58467 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Setd4P58467 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Setd4P58467 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Setd4P58467 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Setd4P58467 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Setd4P58467 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Setd4P58467 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Setd4P58467 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Setd4P58467 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Setd4P58467 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Setd4P58467 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Setd4P58467 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Setd4P58467 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Setd4P58467 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Setd4P58467 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Setd4P58467 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Setd4P58467 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Setd4P58467 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Setd4P58467 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Setd4P58467 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Setd4P58467 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Setd4P58467 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms