Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dpf3P58269 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dpf3P58269 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms