Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpdl3bP58242 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpdl3bP58242 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms