Protein–RNA interactions for Protein: P58021

Tm9sf2, Transmembrane 9 superfamily member 2, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf2P58021 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tm9sf2P58021 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tm9sf2P58021 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tm9sf2P58021 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tm9sf2P58021 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tm9sf2P58021 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tm9sf2P58021 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tm9sf2P58021 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tm9sf2P58021 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tm9sf2P58021 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tm9sf2P58021 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf2P58021 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms