Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NcstnP57716 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NcstnP57716 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NcstnP57716 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NcstnP57716 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NcstnP57716 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NcstnP57716 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NcstnP57716 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcstnP57716 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NcstnP57716 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NcstnP57716 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NcstnP57716 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms