Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad23bP54728 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad23bP54728 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad23bP54728 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad23bP54728 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad23bP54728 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad23bP54728 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad23bP54728 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad23bP54728 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad23bP54728 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad23bP54728 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad23bP54728 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad23bP54728 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad23bP54728 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad23bP54728 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad23bP54728 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad23bP54728 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad23bP54728 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad23bP54728 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad23bP54728 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad23bP54728 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad23bP54728 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms