Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad23aP54726 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms