Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PctpP53808 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PctpP53808 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PctpP53808 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PctpP53808 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PctpP53808 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PctpP53808 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PctpP53808 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PctpP53808 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PctpP53808 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PctpP53808 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PctpP53808 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PctpP53808 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PctpP53808 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PctpP53808 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PctpP53808 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PctpP53808 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PctpP53808 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PctpP53808 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PctpP53808 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PctpP53808 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PctpP53808 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PctpP53808 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PctpP53808 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PctpP53808 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PctpP53808 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PctpP53808 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PctpP53808 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PctpP53808 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PctpP53808 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PctpP53808 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PctpP53808 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PctpP53808 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PctpP53808 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PctpP53808 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PctpP53808 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PctpP53808 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PctpP53808 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PctpP53808 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PctpP53808 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PctpP53808 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PctpP53808 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PctpP53808 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PctpP53808 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PctpP53808 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PctpP53808 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PctpP53808 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PctpP53808 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PctpP53808 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PctpP53808 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PctpP53808 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PctpP53808 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PctpP53808 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PctpP53808 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PctpP53808 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PctpP53808 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PctpP53808 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PctpP53808 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PctpP53808 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PctpP53808 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PctpP53808 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PctpP53808 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PctpP53808 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PctpP53808 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PctpP53808 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PctpP53808 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PctpP53808 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PctpP53808 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PctpP53808 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PctpP53808 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PctpP53808 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PctpP53808 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PctpP53808 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PctpP53808 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PctpP53808 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PctpP53808 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PctpP53808 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PctpP53808 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PctpP53808 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PctpP53808 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PctpP53808 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PctpP53808 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PctpP53808 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PctpP53808 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PctpP53808 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PctpP53808 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PctpP53808 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PctpP53808 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PctpP53808 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PctpP53808 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PctpP53808 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PctpP53808 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PctpP53808 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PctpP53808 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PctpP53808 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PctpP53808 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PctpP53808 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PctpP53808 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PctpP53808 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PctpP53808 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms