Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cux1P53564 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cux1P53564 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cux1P53564 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cux1P53564 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cux1P53564 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cux1P53564 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cux1P53564 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms