Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClgnP52194 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClgnP52194 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClgnP52194 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClgnP52194 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClgnP52194 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClgnP52194 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClgnP52194 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClgnP52194 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ClgnP52194 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ClgnP52194 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ClgnP52194 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ClgnP52194 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ClgnP52194 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ClgnP52194 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms