Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr5P51682 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr5P51682 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms