Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc13P50207 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms